MacVectorは、分子生物学者のためにMacintosh専用に開発された、デスクトップ型の統合解析ツールです。Macintosh OSXの使い易いGUI機能をフルに活用し、シーケンスデータ編集、PCRプライマー設計、インターネット経由でのデータベースサーチ、蛋白質解析など研究者が必要とするあらゆる解析を提供いたします。また、オプションのAssemblerを利用することで、シーケンサーからのデータを用いたアセンブル、コンティグ作成が可能となります。
シーケンスデータ編集
●ファイルフォーマット ●配列編集 ●フィーチャーとアノテーション編集 ●フィーチャーのグラフィック表示 ●クリッククローニング機能
プライマー設計
●シーケンスプライマーおよびハイブリダイゼージョンプローブの設計 ●シーケンスプライマーとハイブリダイゼーションプローブのテスト ●PCRプライマーの設計 ●PCRプライマーのテスト
DNA解析
●塩基配列の組成分析 ●制限酵素サーチ ●DNAサブシーケンスのサーチ ●DNA対DNAまたはDNA対蛋白質間のドットプロット比較
蛋白質解析
●蛋白質分解酵素の探索 ●アミノ酸モチーフ検索 ●蛋白配列のアミノ酸配列への逆翻訳 ●ドットプロット解析
データベースサーチ
●NCBI Entrezへのキーワードサーチ ●NCBIデータベースにおけるBLASTサーチ機能 ●FastAを利用したインハウスデータベースへの類似検索 ●サーチ結果のアライメントをテキストで表示
マルチプルアライメント
●ClustalWを利用してのアミノ酸配列および蛋白配列のアライメント ●ClustalWアルゴリズムをオリジナルの3倍以上のパフォーマンスにチューニング ●進化系統樹の作成(NJ法およびBootstrap法) ●ペア配列の一致や類似のマトリックス表示
シーケンスアセンブルオプション(MacVector Assembler)
●Phredアルゴリズムによるベースコーリング機能 ●Phrapアルゴリズムのよるシーケンスアセンブル機能 ●ベクター配列のトリミングおよびマスク機能 ●コンティグの編集と解析