世界で始めてのライフサイエンス専用検索エンジン
NextBioは、世界中で公開されている膨大な生命科学情報リソースを簡単な操作で検索するために開発された、これまでに例のない検索エンジンです。
公開情報は一般的な遺伝子配列、タンパク質配列、文献の他に、遺伝子発現に関する情報をはじめ各種ゲノム、パスウェイ、疾患の情報、また、これらに関係する化合物、医薬品の生物試験情報、プロテオミクスの関連情報など様々な種類のものがあります。 しかし、多くの情報は異なった専門用語や類似語を利用しているため、通常の用語検索エンジンでは同時に検索することが出来ません。 遺伝子の発現や化合物の作用などの重要な実験情報の検索を行おうとした場合、それぞれの情報リソースは異なった表記方法を用いているため一元的に比較することができません。
世界中の生命科学情報を検索できる仕組み
世界中で公開されている膨大な生命科学情報リソースを簡単な操作で検索するためにNextBioは情報公開元と直接技術交換を行い、Representational State Transfer（REST）を利用して迅速な情報コンテンツを入手し、NextBio独自のアルゴリズムを利用してNextBio独自のデータベース化を行っています。
情報の詳細はオントロジーを考慮して膨大な量のインデックスに分類され、それぞれの情報に必要なタグの作成を行います。
NextBioの中核となるオントロジーは、Biogroupと呼ぶNextBio独自のコンテンツライブラリーに集約されています。オントロジーインデックスはthe Gene Ontology Consortiumと Broad Institute's MSigDBで標準化された記載方法に基づいて作成されています。
また、マイクロアレイのデータに関してはNCBI GEO (Gene Expression Omnibus)、ArrayExpress、SMD (Stanford Microarray Database)をはじめとする機関や、その他の開発元と提携して遺伝子リストの完全な相互参照インデックスを作成しています。
新たにタグが作成された情報は、NextBioによるマニュアルキュレーションによってさらに正確かつ付加価値を持つ情報として検索が可能になります。
【製品ラインナップ】
| NextBio Basic |
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NextBioの公開するBasic版は、何方にでもフリーに検索が実行できるライフサイエンス
分野に特化した検索エンジンです。検索のためのキーワードは、遺伝子名、化合物名、
疾病名など、あらゆる用語が利用できます。
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| NextBio Professional |
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NextBioの有償サービスとなるサイトです。本サイトは、Basic版と異なり、NextBioサー
バへはhttps接続となり、ご研究者の方々が登録する自身のデータのセキュリティを保証
いたします。また、Basic版ではできない、アドバンスドサーチ機能が利用可能となります。 |
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| NextBio Enterprise |
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Professional版と同様、NextBioが提供する有償サービスサイトです。本サービスは、特
に製薬企業や大規模な研究室において、より効果的にNextBioの検索環境が利用でき
ることを目的としています。
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取扱商品
