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GeneBio
Phenyx
GeneBio社製蛋白質同定ソフトウェア
新しいプロテオミクス解析ソフトウェア
Phenyxは、マススペクトロメトリーのデータを用いて蛋白質やペプチドの同定を行うためのソフトウェアです。Phenyxは、スイス生物情報研究所(SIB – Swiss Institute of Bioinformatics)の強力の元にGeneBio社が開発した、純確率/数学的理論に基づく柔軟なスコアリングシステムOLAVを搭載しています。
Phenyxの構成要素
Phenyxは、2つの主要な要素、Phenyx ClientおよびPhenyx Calculation Unitで構成されています。Phenyx Clientは、Webインターフェイスの形で利用することができます。Phenyx Calculation Unitは、SIBにある高速パブリック・サーバーにネットワークで接続して使用できる他、セキュリティーの心配のないお客様自身のサーバにインストールする方法のいずれかの形で提供されます。
機能概要
  • SIBとの強力の元に開発された純確率/数学的理論に基づくスコアリングシステムOLAV搭載
  • 質量分析装置の違いによる計測値のばらつきを補正
  • 類似配列の競合表示(conflict)の解消による、代表配列のみの表示機能>
  • 他のソフトウェアでの解析結果を取り込むことでの、複数のアルゴリズムによる結果比較
  • マニュアルバリデーションに便利なマルチウインドウ表示
  • 精度の低いピークリストのふるい落としや感度の高いヒットを見つけるための1〜2段階解析設定
  • 質量分析装置メーカーや、機種の違いによる最適なスコアリングセットを提供
  • Perlスクリプト、Perlモジュール、およびXML結果ファイルの利用

【製品イメージ】

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