Macintosh専用
デスクトップタイプ遺伝子配列解析ツール
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MacVectorは、分子生物学者のためにMacintosh専用に開発されたデスクトップ型の統合解析ツールです。Macintosh OSXの使い易いGUI機能をフルに活用し、シーケンスデータ編集、PCRプライマー設計、インターネット経由でのデータベースサーチ、蛋白質解析など研究者が必要とするあらゆる解析を提供いたします。
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シーケンスアセンブルのための
オプションモジュール
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MacVector Assemblerは、MacVectorのオプションとして開発されたシーケンスアセンブル、コンティグ作成のための専用モジュールです。業界標準のPhred1,2,3およびPhrap4アルゴリズムを利用することで、単なるシーケンサからのデータ読み取り、配列比較、SNPs解析だけでなく、卓越したアセンブル機能を実現します。
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| 機能概要 |
- NCBI BLSTおよびEntrezサーチを利用してのデータベースサーチ機能
- ClustalWアルゴリズムを利用してのマルチプルアライメント機能
- 制限酵素のマッピング
- アライメント結果からの系統樹作成
- リファレンスシーケンスに対する自動アセンブル機能
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- PCRプライマーおよびハイブリダイゼーションプローブ設計
- 核酸やペプチドのモチーフ検索
- 蛋白質解析機能
- あらゆるフォーマットでのファイル入力および出力機能
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| シーケンスデータ編集 |
- 様々なファイルフォーマットによるシーケンスファイル読み込みと出力
- リニアマップおよびサーキュラーマップ作成
- 配列データやアノテーションの編集
- OSX "Quortz" をサポートすることでの卓越したグラフィックス表示
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| プライマー設計 |
- PCRプライマーおよびプローブの設計
- 既存のプライマー、ハイブリダイゼーションプローブのテスト
- PCRプライマーペアの探索
- PCRプライマーテスト
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| DNA解析 |
- 塩基配列の組成分析
- 制限酵素サーチ
- DNAサブシーケンスのサーチ
- DNA対DNAまたはDNA対蛋白質間のドットプロット比較
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| 蛋白質解析 |
- 蛋白質分解酵素の探索
- アミノ酸モチーフ検索
- 蛋白配列のアミノ酸配列への逆翻訳
- ドットプロット解析
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| データベースサーチ |
- NCBI Entrezへのキーワードサーチ
- NCBIデータベースにおけるBLASTサーチ機能
- FastAを利用したインハウスデータベースへの類似検索
- サーチ結果のアライメントをテキストで表示
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| マルチプルアライメント |
- ClustalWを利用してのアミノ酸配列および蛋白配列のアライメント
- ClustalWアルゴリズムをオリジナルの３倍以上のパフォーマンスにチューニング
- 進化系統樹の作成（NJ法、UPGMA法およびBootstrap法）
- ペア配列の一致や類似のマトリックス表示
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| シーケンスアセンブル（MacVector Assembler） |
- Phredアルゴリズムによるベースコーリング
- Phrapアルゴリズムによるシーケンスアセンブル
- ベクターシーケンスのトリミングとマスク機能
- コンティグの編集と解析
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取扱商品
